Считается, что монастырь возник в самые первые годы армянского христианства.
В то время он имел вид нескольких пещер в скале и вроде бы сам Григорий Просветитель жил здесь какое-то время. В более поздние эпохи здесь возникли какие-то сооружения, но два арабских нашествия - в IX и X веках - уничтожили всё. Новая фаза в жизни монастыря началась через несколько лет после смерти царицы Тамары. В 1215 князья Мхаргрдзели построили здесь основной храм, а через 6-7 лет пристроили к нему гавит, который частично вырезан в скале. Еще лет через 20 в скале за храмом были высечены три храма. Все это сделало Гегард немного напоминающим Вардзию.
После Мхаргрдзели монастыр попал в руки клана Прошьянов, который сделали его фамильной усыпальницей. В 1288 году ими был построен так называемый ʺгавит Папакʺ - вроде бы единственный на всю Армению гавит, полностью высеченный в скале.
Уже веке в XVII монастырь был окружен хозяйствеными пристройками.
Использованы фотоматериалы с сайтов: etotam.com; www.aerobileti.com; livingintravels.com