После его скоропостижной смерти работы проходили под контролем его сына М. М. Мейшнера, а впоследствии, в связи со смертью и этого архитектора — под руководством нового губернаторского архитектора Е. Ф. Лыщинского. На сегодняшний день здание храма принадлежит архиву и находится в аварийном состоянии. Между тем, там хранится 740 тыс. дел, то есть более половины дел Смоленского архива, в том числе ценнейшие письменные исторические свидетельства: ревизские сказки и метрики, документы XVII века, пережившие все пожары и войны. На всю высоту здания установлены деревянные стойки и балки шестиярусных стеллажей с документами. Орган сняли и отправили в утиль еще в 50-е, на месте органных труб теперь тоже стеллажи. Некогда поражающие своей красотой витражи сегодня выбиты. Вместо них вставлены листы фанеры, поэтому на первом ярусе всегда темно. Из-за аварийного состояния здания сюда исследователей давно уже не пускают. Богослужения католики проводят в часовне рядом с храмом. Здание храма — объект культурного наследия федерального значения.
