Останки из Вади-аль-Хитана не были первыми обнаруженными образцами древних китов, однако отличаются большим количеством и хорошей сохранностью — сохранилось даже содержимое желудков некоторых образцов. Найденные в Вади аль-Хитан останки других животных — акул, крокодилов, пилорылых, черепах и скатов — позволяют воссоздать окружающую среду и экологическое состояние того периода. Первые ископаемые останки были найдены в Вади-аль-Хитан зимой 1902—1903 года. Окаменелости относятся к самым ранним представителям Archaeoceti и отражают стадию их развития, на которой они уже почти полностью утратили свои задние конечности, их тело имело обтекаемую форму, как у современных китов, но зубная система и череп всё ещё имели примитивное строение. Самый крупный скелет достигает длины 21 м, на нём имеются хорошо развитые перепонки с пятью пальцами и неожиданно хорошо развитые задние конечности, ранее неизвестные ни у одного из видов древних китов. Их форма была змеевидная и они были плотоядными. Вади-аль-Хитан является также местом обитания 15 видов пустынных растений, 15 видов млекопитающих, включая североафриканского шакала, красную лисицу, египетского мангуста, африканскую дикую кошку и других. Также зарегистрировано присутствие 19 видов пресмыкающихся и 36 видов птиц, которых привлекают озёра Вади-аль-Раяна. В июле 2007 года египетское правительство заявило, что 2 машины, управляемые бельгийскими дипломатами, заехали на охраняемую территорию и нанесли ущерб в размере 325 000 долларов США. Бельгийское правительство отказалось признать факт нанесения ущерба своими дипломатами. Инцидент остался нерешённым.
