При покровительстве йоркских архиепископов и цистерцианского ордена монастырь превратился в один из самых грандиозных памятников английской готики. В 1539 году, в разгар английской реформации, король Генрих VIII закрыл все монастыри Англии. Здание аббатства было разрушено, а принадлежащие ему земли перешли во владение короны. Через год они были проданы лондонскому купцу Ричарду Грешэму, сын которого Томас Грешэм основал Лондонскую биржу. Часть строительного материала пошла на постройку Фаунтинс-холла — единственного в округе памятника гражданского зодчества елизаветинского периода. С возрождением в XVIII—XIX вв. интереса к готической архитектуре Фаунтинское аббатство стало привлекать множество туристов. Вокруг его романтических руин раскинулся королевский парк Стадли с построенной при королеве Виктории церковью св. Марии.