Вход в пещеру нашёл в 1961 году Гиви Смыр, который рассказал о своей находке спелеологам. 14 июля 1961 г. штурмовая отряд в составе 5 человек, преодолев каскад колодцев, на глубине 135 м впервые проникла в зал Анакопия. После этого были открыты и остальные залы пещеры. С 1975 года пещера открыта для посещения туристами. Новоафонская пещера состоит из 9 залов, в 6 из которых проводятся ежедневные экскурсии, один зал зарезервирован для научной работы. Первоначальные названия залов дважды изменялись на новые: перед открытием пещеры для экскурсий в 1975 году и после грузино-абхазской войны 1992-93 годов. Экскурсионный маршрут включает залы Анакопия, Махаджиров, Нартаа, Кораллитовую галерею, зал Аюхаа, Апхярца и Апсны. Самый большой зал пещеры — зал ʺМахаджировʺ. Его длина — 260 метров, высота — до 50 метров, ширина — до 75 метров. А самый высокий зал пещеры — зал ʺСпелеологовʺ, его высота достигает 97 метров. Самые красивые залы пещеры — Зал имени Гиви Смыр, ʺАнакопияʺ, Геликтитовый грот и Кораллитовая галерея (галерея ʺКаменных цветовʺ). Одной из достопримечательностей зала ʺАнакопияʺ является озеро ʺАнатолияʺ. Площадь озера 1000 м², глубина 26 м, температура воды 10 градусов Цельсия. Также в этом зале находится ʺГолубое озероʺ размером 1250 м². В зале ʺГеликтитовый гротʺ, зарезервированном для научных работ, находится большое количество натёчно-капельных образований — геликтитов. Рядом находится каменный водопад ʺАпсныʺ, высота которого 20 метров, ширина — 6 метров. Новоафонская пещера имеет 4 входа, 3 из которых искусственные (в залах ʺАнакопияʺ и ʺАпсныʺ они входят к подземным железнодорожным станциям), а также специально пробитая из зала ʺИсчезающего озераʺ водоотводная галерея. Единственный естественный вход, через который первоначально и проникли в полость, можно увидеть в потолке зала ʺАнакопияʺ. На поверхности этот выход примыкает к селу Эшера, в виде глубокого провала. Новоафонская пещера не является крупнейшей пещерой Абхазии ни по длине, ни по объёму полости. По объёму она значительно уступает пещере Снежная, а по длине не входит даже в десятку длиннейших пещер Абхазии. Однако пещера уникальна тем, что это единственная пещера с небольшой линией метро, а также самым длинным подземным мостом (эстакадой) протяжённостью 120 метров!
Использованы фотоматериалы с сайтов: g-a.d-cd.net; d-a.d-cd.net; newsinphoto.ru; f-a.d-cd.net; 24warez.ru; b-a.d-cd.net; a-a.d-cd.net; h-a.d-cd.net
